Kui kiiresti koronaviirus võib muteeruda?

Uus koronaviirus, nagu ka kõik muud viirused, muteerub või muudab selle genoomis väikseid muutusi. Hiljuti avaldatud uuring näitas, et uus koroonaviirus SARS-CoV-2 on juba muteerunud ühte ja ühte vähem agressiivsesse tüve. Kuid eksperdid pole selles veendunud.

Teadlased leidsid 70% -l viiruseproovidest L-tüüpi, mida nad pidasid agressiivsemaks tüübiks. Samuti leidsid nad, et selle tüve levimus vähenes pärast jaanuari algust. Tänapäeval on sagedamini levinud tüüp vanem, "S" tüüp, kuna "inimese sekkumine", näiteks karantiinid, võib olla vähendanud "L" tüübi levimisvõimet, kirjutasid teadlased artiklis.

Yale'i rahvatervise kooli epidemioloog Nathan Grubaugh, kes uuringusse ei kuulunud, ütles autorite järeldusi siiski "puhtaks spekulatsiooniks". Esiteks, tema sõnul olid mutatsioonid, millele uuringu autorid viitasid, uskumatult väikesed - paar nukleotiidi, geenide põhielementide järjekorras, ütles ta. (SARS-CoV-2 on umbes 30 000 nukleotiidi pikk).

Neil väikestel muutustel pole tõenäoliselt suurt mõju viiruse toimimisele, kui üldse, siis oleks "ebatäpne" öelda, et need erinevused tähendavad, et tüvesid on erinevaid, ütles ta. Lisaks vaatasid teadlased vaid 103 juhtumit. "See on väga väike kogu viirusepopulatsioon," rääkis Grubaugh Live Science'ile. Viiruse ülemaailmselt läbi viidud mutatsioonide välja selgitamine nõuab "ebaolulist jõupingutust ja mõnikord võtab see aega aastaid", ütles ta.

Teised teadlased on sellega nõus. Leide, et koroonaviirus muteerub kaheks tüveks, L-tüvega, mis viib raskema haiguseni, "on tõenäoliselt statistiline ese," kirjutas Šveitsis Baseli ülikooli bioloog ja füüsik Richard Neher Twitteris. See statistiline efekt on tõenäoliselt tingitud L-rühma varasetest proovidest Wuhanis, mille tulemuseks on "kõrgem ilmne" haigusjuhtude suremus, kirjutas ta.

Kiiresti kasvava kohaliku haiguspuhangu korral proovisid teadlased patsientidelt kiiresti viiruse genoome, mille tulemusel viiruse mõned variandid olid üleesindatud, kirjutas Neher. Paberi autorid tunnistavad, et nende uuringu andmed on "endiselt väga piiratud" ja nad peavad jälgima suuremate andmekogumitega, et paremini mõista, kuidas viirus areneb, kirjutasid nad.

"Me ei peaks muretsema"

Teades, et sellised paberid ilmnevad selle puhangu ajal, avaldas Grubaugh 18. veebruari ajakirjas Nature Microbiology kommentaari pealkirjaga "Me ei peaks muretsema, kui viirus haiguse puhangute ajal muteerub."

Sõna mutatsioon "võltsib loomulikult hirmu ootamatute ja veidrate muutuste ees", kirjutas ta. "Tegelikult on mutatsioonid viiruse elutsükli loomulik osa ja mõjutavad dramaatiliselt puhanguid." RNA-viirused või need, mille peamiseks geneetiliseks materjaliks on RNA, mitte DNA, sealhulgas SARS-CoV-2, muteeruvad pidevalt ega oma mehhanisme nende "vigade" parandamiseks, nagu näiteks inimese rakud.

Kuid enamik neist mutatsioonidest mõjutab viirust negatiivselt. Kui mutatsioonid ei ole viirusele kasulikud, elimineeritakse need tavaliselt loodusliku valiku abil, evolutsioonimehhanismina, mille abil organismid, kes on oma keskkonnaga paremini kohanenud, kipuvad ellu jääma. Muud mutatsioonid jäävad ellu ja kinnistuvad viiruse "keskmisesse" genoomi.

Tavaliselt kodeerivad mitmed geenid selliseid tunnuseid nagu viiruse raskus või võime teistele inimestele edasi kanduda, kirjutas Grubaugh. Niisiis, et viirus muutuks raskemaks või hõlpsamini edasi, peaksid mitmed geenid muteeruma. Vaatamata üldiselt kõrgele viiruste mutatsioonimäärale, on ebatavaline leida viirusi, mis muudavad nende edasikandumisviisi inimeste vahel nii lühikese aja jooksul, kirjutas ta.

Mida see kõik tähendab võimaliku vaktsiini väljatöötamist?

Need viirused "on endiselt nii geneetiliselt sarnased, et need mutatsioonid ei tohiks uut vaktsiini muuta", ütles Grubaugh. On "ebatõenäoline, et arendajad selle pärast muretsema peaksid." Kui vaktsiin on läbi saanud, võib viirus sellega siiski kohaneda ja resistentsuse välja töötada, kuid arvestades, et teistel RNA-viirustel - näiteks leetrite, mumpsi ja kollapalavikku põhjustavatel viirustel - ei arenenud vaktsiinide suhtes resistentsust, leidis see stsenaarium on ebatõenäoline.

Tegelikult aitavad need mutatsioonid teadlastel jälgida viiruse etappe, ütles Grubaugh.

Näiteks eraldas Brasiilia teadlaste rühm hiljuti kahelt patsiendilt SARS-CoV-2, et neil on COVID-19 ja nad järjestavad viiruse mõlema proovi täielikud genoomid. Nad leidsid, et mitte ainult genoomid ei erine üksteisest, vaid nad erinesid ka Hiinas Wuhanis järjestatud viiruseproovide genoomidest väga palju, kirjutasid teadlased aruandes, mida ei retsenseeritud, vaid avaldati foorumis 28. veebruaril.

Ühest Brasiilia patsiendilt võetud koroonaviiruse genoom sarnanes Saksamaal sekveneeritud viiruse genoomiga ja teise patsiendi viirus sarnanes Ühendkuningriigi koroonaviiruse omaga. See tähendab, et need kaks patsienti on seotud Euroopas juhtumitega, kuid mitte üksteisega, ütles Grubaugh.